La investigación en el CEIMD comenzó en los primeros años de la década de los 90, alrededor de los Juegos Olímpicos de Barcelona 92, con estudios relacionados con el alto rendimiento físico. En la segunda mitad de esa década comenzaron los proyectos sobre ejercicio físico y salud, con unos primeros estudios orientados a prevenir la dependencia funcional en personas ancianas, colaborando con el Servicio de Geriatría del Hospital de Navarra. Desde entonces, se han seguido diferentes líneas de investigación en el área del alto rendimiento deportivo y en la del ejercicio físico- salud, con colaboraciones con el Complejo Hospitalario de Navarra (Servicios de Endocrinología, Neumología, Cardiología y Oncología) y con otros organismos nacionales e internacionales, que han dado como resultado diferentes publicaciones en revistas científicas especializadas.